本系所因應社會治安與司法制度的改變，自民國78年設立大學部，於民國85年及90年陸續成立碩士班及博士班，教學研究領域隨著國際發展趨勢演進而持續擴展與提升，早年較偏重於傳統的物理、化學與生物鑑識方法，分析較大量的證物，例如指紋、槍彈與文書鑑識、藥毒物、玻璃、土壤、刑事血清鑑識等；接續發展新的刑事DNA 鑑識領域，將個化分析從指紋證物大幅度移轉至DNA 證物，並且在精密儀器的輔助下，微量證物分析成為科學辦案的重要利器，包括毛髮、纖維、塗料、火場殘跡、藥毒物、玻璃、爆炸物、射擊殘跡等。近年來刑事生物有關之刑事昆蟲鑑識、植物鑑識亦突飛猛進，影像處理與鑑識更是追蹤犯嫌的主要技術，此外、鑑識法學在新刑事訴訟交互詰問制度下，逐漸受到重視與要求，與物證鑑識相關法學課題等將成為下一波研究發展的重點。本系所師資因應實務需求，依領域發展需求逐年增聘師資，健全教學研究專業分工，並成立系所自我評鑑指導委員會、系課程會等組織，經常與鑑識實務單位、司法機關與國際上歐美日澳等學校密切接觸交流，即時掌握最新的專業核心職能需求，不斷修正教育計畫與研究方向，並共同合作參與政府科技研究計畫，以發展出能解決現存鑑識難題的先進技術，培養當前所需之刑事鑑識專業人才。